Na cmentarzu w Krzyżu znajdują się także trzy kwatery wojenne :
Kwatera Żołnierzy Polskich poległych w latach 1939 - 1945. Powierzchnia kwatery wynosi 560 m2 i pochowanych jest w niej około 99 żołnierzy . Założona została w 1939 r. W roku 1951 inż. Marian Skoczek zaprojektował pomnik poległym żołnierzom polskim. Wykonany z betonu i piaskowca pińczowskiego, w kształcie prostokątnego pomnika, pośrodku którego na szczycie umieszczono kamiennego orła. Obecnie znajduje się tam orzeł żeliwny. Przed pomnikiem znajduje się mogiła zbiorowa żołnierzy poległych w czasie kampanii wrześniowej oraz pojedyncze mogiły oznakowane tabliczkami z nazwiskami poległych.

Kwatera Żołnierzy Radzieckich poległych w 1945 r. oraz zmarłych w obozie jenieckim przy ul. Dzierżyńskiego ( obecna Mościckiego). Została założona w 1946 r. przez komitet, w skład którego weszli obywatele miasta Tarnowa , przedstawiciele PPS i wojskowi radzieccy. W dniach 16 - 17 lutego 1948 r. dokonano ekshumacji mogił żołnierzy radzieckich w dawnym powiecie brzeskim i tarnowskim, a ich szczątki przeniesiono na Cmentarz w Krzyżu. Znajduje się tam 6 mogił zbiorowych otoczonych niskim murkiem betonowym i oznaczonych betonowymi konsolami z brązu, jako elementy dekoracyjne w kształcie gwiazdy. Na froncie mogił wzniesiono w 1948 r. pomnik w kształcie prostopadłościanu wykonanego z marmuru i zwieńczonego marmurowym obeliskiem. Kwatera zajmuje powierzchnię 1.140 m2 Pochowano w niej 366 żołnierzy. W Miejskim Zarządzie Cmentarzy znajduje się spis żołnierzy radzieckich poległych lub zmarłych na terenie Tarnowa i okolic.

Kwatera NN - nieznanych osób cywilnych pochowanych w mogile zbiorowej. Kwatera ma powierzchnię 108 m2. Założona została w 1939 r. po wybuchu bomby na tarnowskim dworcu kolejowym. Ofiary tego wybuchu, 22 osoby, pochowane zostały na cmentarzu w Krzyżu.

Następne pochówki, to ofiary z czasów okupacji hitlerowskiej z lat 1939 - 1944. Pogrzebani tu zostali ludzie zamordowani w tarnowskim więzieniu, zamęczeni w katowni gestapo przy ul. Urszulańskiej, zastrzeleni podczas ucieczek i znajdowani na ulicach miasta. Ogółem w kwaterze tej pochowanych zostało ok. 359 ofiar.

Aleja Zasłużonych. 14.07.1978 r. Urząd Miejski - Wydział Gospodarki Terenowej i Ochrony Środowiska wydał polecenie wykonania Alei Zasłużonych. Chowani tu byli działacze organizacji państwowych i politycznych, którzy wg ówczesnych władz, zasłużyli sobie na taki pochówek. Aleja nie cieszyła się sympatią tarnowian. Bywały przypadki, szczególnie po upadku ustroju komunistycznego, że rodziny przenosiły swoich zmarłych do mogił rodzinnych.

Kwatera niemiecka. Na cmentarzu istniała również kwatera żołnierzy niemieckich, gdzie chowani byli żołnierze Wermachtu, którzy zginęli w czasie działań wojennych w 1939 r. oraz żołnierze zmarli w szpitalu niemieckim w Tarnowie. W roku 1945 teren tej kwatery został zrównany z ziemią przez nieznane osoby, tak że nie można było odnaleźć żadnych znaków mogilnych, ani ogrodzenia. Dopiero w roku 1997, na wniosek Niemieckiego Związku Opieki nad Grobami Wojennymi, dokonano ekshumacji i wydobyto 115 szczątków żołnierzy niemieckich oraz przestrzelone hełmy niemieckie, szczątki mundurów, numery identyfikacyjne poległych. Prawdopodobnie w mogile tej pochowany był również generał niemiecki, ponieważ w wykopie znaleziono dystynkcje generalskie.

Nowa część cmentarza oddana została do użytkowania dnia 01. 03. 2000 r. decyzją Zarządu Miasta Tarnowa jako poszerzony obszar dotychczasowego cmentarza w Krzyżu. Pierwszego pochówku na tym cmentarzu dokonano dnia 28 kwietnia 2000 r. Poświęcenie cmentarza przez ks. Biskupa Wiktora Skworca odbyło się 10.05.2000 r.